Diare kronik (lebih dari 14 hari) memang masih sulit diatasi, karena penyebabnya bermacam-macam. Antara lain infeksi (bakteri, parasit, atau jamur), intoleransi laktosa, alergi susu sapi, malabsorpsi (gangguan penyerapan zat gizi), atau karena antibiotik. Maka sebaiknya anak dibawa ke dokter anak yang mendalami bidang gastroenterology. Di sana ia akan menjalani beberapa pemeriksaan:

• Analisis tinja untuk menilai adanya intoleransi laktosa.
• Kultur tinja untuk mencari mikroorganisme penyebab inmfeksi usus.
• Menghindari susu sapi untuk mengecek kemungkinan alergi susu sapi.
• Pemeriksaan lain sesuai kecurigaan penyebab diare kronik